1．MATLAB加速

 

　　诸如 MATLAB、Mathematica 和 LabView 等数学计算软件应用程序，将可以极大地受益于基于 CUDA 的 GPU使用。除了为主要内核编写 CUDA 函数外，这些高级脚本编写和语言软件应用程序还可以使用 CUDA FFT 和 BLAS 函数库。

使用基于 CUDA 的 GPU加速 MATLAB 运行性能

·    适用于 MATLAB 的 Jacket 引擎

·    使用 MEX 文件的 MATLAB 插件

o   技术说明阐述了如何使用插件

·    GPULib：适用于 IDL 和 MATLAB 的数学函数

·    使用 MEX 文件的 MATLAB CUDA 插件

·    使用 CUDA 的 Canny 边缘检测

·    CUDA MATLAB 教程

·    基于 CUDA 的 2D 双线性外推法

2．生物信息学以及生命科学

使用CUDA的生物信息学软件

·    GPU HMMER：CUDA GPU上的HMMER

·    MUMmerGPU：利用CUDA进行高吞吐量DNA序列比对

·    使用支持CUDA的GPU执行Folding @ home

·    LISSOM：使用CUDA处理人体新大脑皮层模型

·    Silicon Informatics所开发的基于CUDA的AutoDock

有关利用CUDA处理生物信息学的技术报告

·    序列比对

o   MUMmerGPU：使用GPU（图形处理器）进行高吞吐量DNA序列比对

o   利用CUDA处理Smith-Waterman序列比对

o   Infernal-GPU：CUDA加速的RNA比对, Infernal（RNA比对的推断）

o   SWAMP序列比对

o   CMatch：快速蛋白质与基因序列串匹配

·    对接

o   3D蛋白质对接

o   利用CUDA加速PIPER:

o   威斯康星大学蛋白质对接工作以及对David Dynerman的电视采访

o   国家癌症研究所的Jack Collins谈GPU计算

·    用于生物系统的随机仿真算法（SSA）

·    人体视觉皮层的自组织计算模型

·    通过在GPU上成对地计算欧几里德距离来分析基因表达的DNA微阵列工具

3．医疗成像

采用基于CUDA 的GPU医疗成像软件/设备

·    GPULib: IDL 加速

·    Digisens SnapCT 体层重建软件

·    针对微 CT 扫描图像重建的 Acceleware AxeRecon library

·    MATLAB 加速

·    Techniscan 全乳超声波成像系统: 成功案例

使用 CUDA 的医疗成像技术报告

·    东京大学立体医疗成像系统

·    基于 CUDA 的 ITK

·    计算体层论文

o   比利时安特卫普大学，数字体层小组

o   通用电气医疗集团 CT 成像论文: 锥形束反投影与透视 CT 重建

o   西门子医疗 CT 重建

o   Klaus Mueller 关于基于 GPU（图形处理器）进行医疗成像的研究

o   三维图像配准

o   快速小波变化配准

o   锥形束 CT 东芝中风研究中心和纽约州立大学水牛城分校

·    基于 CUDA 的 MRI

o   加速 MRI 中的 GRAPPA 自动校准

o   快速 MRI 网格化

o   高级 MRI 重建